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人文社會
文史數位工具培訓課程｜歷史地理資訊系統
數位人文實驗室 教授
資訊與通訊科技的快速發展與運用已引發了所謂的「數位革命」，人文學者所棲處的社會與文化情境也有了天翻地覆的改變，其原本慣習的研究工具與研究方法，乃至思考問題的概念架構，以及判斷學術品質良窳高下的標準，也已面臨日益增加的挑戰，人文研究的「典範轉移」似乎正在進行之中。
因此，本研究室擬結合數位科技的專家與人文領域的學者，共同探索如何利用數位科技與數位內容進行人文研究，以建立新的研究典範。此外，我們也希望能共同探索數位科技對於人類社會與文明所帶來的衝擊，並省思因應之道。
教學進度
Syllabus
| 講 次 | 教 學 進 度 |
| 第１講 | 雲端上的寶藏:現代與歷史空間圖資 |
| 張智傑老師｜中央研究院人文社會科學研究中心地理資訊科學研究專題中心 | |
| 第２講 | Quantum GIS操作 |
| 劉濠雄老師｜中央研究院人文社會科學研究中心地理資訊科學研究專題中心 | |
| 第３講 | GPS介紹與田野調查應用 |
| 張智傑老師｜中央研究院人文社會科學研究中心地理資訊科學研究專題中心 | |
| 第４講 | 歷史地理資訊系統HGIS |
| 劉濠雄老師｜中央研究院人文社會科學研究中心地理資訊科學研究專題中心 | |
| 第５講 | 門牌地址的定位服務 |
| 劉濠雄老師｜中央研究院人文社會科學研究中心地理資訊科學研究專題中心 | |
| 第６講 | 統計資料GIS化 |
| 劉濠雄老師｜中央研究院人文社會科學研究中心地理資訊科學研究專題中心 | |
| 第７講 | 六朝健康歷史地理信息化研究－基於歷史地理文獻與城市考古資料｜上午專題演講 |
| 南京大學陳剛教授 | |
| 合辦單位｜禮俗宗教研究室、數位人文學研究室 | |
| 第８講 | 六朝健康歷史地理信息化研究－基於歷史地理文獻與城市考古資料｜下午系統展示 |
| 南京大學陳剛教授 | |
| 合辦單位｜禮俗宗教研究室、數位人文學研究室 | |
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人文社會
文史數位工具培訓課程｜社會網絡分析
數位人文實驗室 教授
資訊與通訊科技的快速發展與運用已引發了所謂的「數位革命」，人文學者所棲處的社會與文化情境也有了天翻地覆的改變，其原本慣習的研究工具與研究方法，乃至思考問題的概念架構，以及判斷學術品質良窳高下的標準，也已面臨日益增加的挑戰，人文研究的「典範轉移」似乎正在進行之中。
因此，本研究室擬結合數位科技的專家與人文領域的學者，共同探索如何利用數位科技與數位內容進行人文研究，以建立新的研究典範。此外，我們也希望能共同探索數位科技對於人類社會與文明所帶來的衝擊，並省思因應之道。
教學進度
Syllabus
| ♠ | QGIS（原稱Quantum GIS）是一個自由軟體的桌面GIS軟體。它提供資料的顯示、編輯和分析功能。 |
| https://zh.wikipedia.org/wiki/QGIS |
| 講 次 | 教 學 進 度 |
| 第1R講 | 上集目錄｜系統介面介紹 |
| 第2R講 | 新增與設定專案 |
| 第3R講 | 地圖影像定位1直接賦予空間座標法 |
| 第4R講 | 地圖影像定位2橡皮伸縮定位法 |
| 第5R講 | 數化點向量圖徵 |
| 第6R講 | 向量圖徵的選取與刪除 |
| 第7R講 | 數位線向量圖徵自動接合 |
| 第8R講 | 數位面向量圖徵 |
| 第9R講 | 儲存專案檔 |
| 第10R講 | 向量檔在Google Earth上展示 |
| 第11R講 | 下集目錄｜shp檔格式介紹 |
| 第12R講 | 轉換shp檔屬性編碼 |
| 第13R講 | 轉換shp檔投影座標系統 |
| 第14R講 | 屬性資料過濾圖層與另存新圖層 |
| 第15R講 | 圖層融合Dissolve |
| 第16R講 | 屬性資料連結Joins |
| 第17R講 | 設計圓餅圖 |
| 第18R講 | 設計文字圖表 |
| 第19R講 | 設計直條圖 |
| 第20R講 | 設計面量圖 |
| 第21R講 | 地圖出版1紙張設定與加入圖名、地圖、比例尺 |
| 第22R講 | 附錄｜CBDB的下載方式 |
| 第23R講 | CBDB的初始設定 |
| 第24R講 | 從CBDB篩選所需資料 |
| 第25R講 | CBDB資料匯入QGIS並另存新圖層 |
| 第26R講 | 利用屬性資料篩選圖層 |
| 第27R講 | 圖層屬性資料處理與繪製分層設色圖 |
| 第28R講 | OpenLayers Plugin的安裝與套疊 |
| 第29R講 | 套疊網路圖磚服務WMTS |
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人文社會
文史數位工具培訓課程｜中國歷代人物傳記資料庫 CBDB 1
數位人文實驗室 教授
對文史研究者而言，中國歷代人物傳記資料庫（China Biographical Database）是一個十分特殊的數位工具。它並非我們熟悉的史料全文資料庫，在 CBDB中，我們並不能看到一篇篇的人物傳記。然而， CBDB擁有許多獨到的查詢功能，彈指之間，即可為諸多問題提供豐富資訊，例如：於南宋寧宗、理宗朝，福建路下的莆田縣共出了多少進士？這些進士彼此間是否有親緣關係？他們在官場上有何互動？他們有哪些共同的友人？透過這些資訊， CBDB能夠協助研究者重構古人的社交圈、探索古人錯綜複雜的社交網絡。
教學進度
Syllabus
| 講 次 | 教 學 進 度 |
| 第１講 | 中國歷代人物傳記資料庫CBDB〡part1 |
| 李宗翰老師〡金門大學閩南文化研究所 | |
| 第２講 | 中國歷代人物傳記資料庫CBDB〡part2 |
| 李宗翰老師〡金門大學閩南文化研究所 | |
| 第３講 | 中國歷代人物傳記資料庫CBDB〡part3 |
| 李宗翰老師〡金門大學閩南文化研究所 | |
| 第４講 | 中國歷代人物傳記資料庫CBDB〡part4 |
| 李宗翰老師〡金門大學閩南文化研究所 | |
| 第５講 | 中國歷代人物傳記資料庫CBDB〡part5 |
| 李宗翰老師〡金門大學閩南文化研究所 | |
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人文社會
QGIS｜原稱Quantum GIS
數位人文 教授
資訊與通訊科技的快速發展與運用已引發了所謂的「數位革命」，人文學者所棲處的社會與文化情境也有了天翻地覆的改變，其原本慣習的研究工具與研究方法，乃至思考問題的概念架構，以及判斷學術品質良窳高下的標準，也已面臨日益增加的挑戰，人文研究的「典範轉移」似乎正在進行之中。
教學進度
Syllabus
| 講 次 | 教 學 進 度 |
| 第１講 | 無知是最大的危險.認識危害就不危險 |
| 楊天頓老師｜政治大學社會學系 | |
| 第２講 | 網路資訊視覺化 |
| 熊瑞梅老師｜政治大學社會學系 | |
| 第３講 | 社會網路分析資料 |
| 鄭力軒老師｜政治大學社會學系 | |
| 第４講 | Network Structure |
| 鄭力軒老師｜政治大學社會學系 | |
| 第５講 | 社會網絡分析SNA-Nodes,Attributes and Relations |
| 楊天頓老師｜政治大學社會學系 | |
| 第６講 | 社會網絡分析SNA-Socialmedia |
| 楊天盾老師｜政治大學社會學系 | |
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人文社會
文史數位工具培訓課程｜中國歷代人物傳記資料庫 CBDB 2
數位人文實驗室 教授
對文史研究者而言，中國歷代人物傳記資料庫（China Biographical Database）是一個十分特殊的數位工具。它並非我們熟悉的史料全文資料庫，在 CBDB中，我們並不能看到一篇篇的人物傳記。然而， CBDB擁有許多獨到的查詢功能，彈指之間，即可為諸多問題提供豐富資訊，例如：於南宋寧宗、理宗朝，福建路下的莆田縣共出了多少進士？這些進士彼此間是否有親緣關係？他們在官場上有何互動？他們有哪些共同的友人？透過這些資訊， CBDB能夠協助研究者重構古人的社交圈、探索古人錯綜複雜的社交網絡。
教學進度
Syllabus
| 講 次 | 教 學 進 度 |
| 第１講 | 1-1 下載與安裝 |
| 第2講 | 2-1 按人查詢 |
| 第3講 | 2-2 按入仕途徑查詢 |
| 第4講 | 2-3 官職查詢 |
| 第5講 | 2-4 查詢親屬關係 |
| 第6講 | 2-5 查詢社會關係 |
| 第7講 | 2-6 查詢社會關係網絡 |
| 第8講 | 2-7 查詢群人之間社會關係 |
| 第9講 | 3-1 多步驟檢索 |
| 第10講 | 3-2 使用Access Query Designer進行檢索 |
| 第11講 | 4-1 如何輸入多筆資料 |
| 第12講 | 4-2 如何將檢索結果輸出到QGIS軟體 |
| 第13講 | 4-3 如何將檢索結果匯入Pajek |
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工程
訊號與系統Offered in English❤️0502微調中❤️
洪樂文 教授
This course introduces basic mathematical tools to analyze continuous/discrete-time signals and linear time-invariant systems that may be encountered in many disciplines of electrical engineering, such as signal processing, communications, circuit design, and control. In this course, we will cover topics such as convolution, filtering, sampling, Fourier series, Fourier transform, Laplace transform, and the z-transform. In essence, students will learn how to view and process signals in both time and frequency domains.
課程簡述
Brief course description
This course introduces basic mathematical tools to analyze continuous/discrete-time signals and linear time-invariant systems that may be encountered in many disciplines of electrical engineering, such as signal processing, communications, circuit design, and control. In this course, we will cover topics such as convolution, filtering, sampling, Fourier series, Fourier transform, Laplace transform, and the z-transform. In essence, students will learn how to view and process signals in both time and frequency domains.
課程大綱
Syllabus
| ♠ | Goal and Overview |
| This course introduces basic mathematical tools to analyze continuous/discrete-time signals and linear time-invariant systems that may be encountered in many disciplines of electrical engineering, such as signal processing, communications, circuit design, and control. In this course, we will cover topics such as convolution, filtering, sampling, Fourier series, Fourier transform, Laplace transform, and the z-transform. In essence, students will learn how to view and process signals in both time and frequency domains. | |
| ♠ | Related Topics |
| Calculus, Linear Algebra. | |
指定用書
Textbook Book
| ♠ | Alan V. Oppenheim and Alan S. Willsky, with S. Hamid Nawab, Signals and |
| Systems, 2nd Ed., Pearson Education Limited, 2014 (or Prentice-Hall, 1997) | |
| ISBN：9781292025902 |
參考用書
References: (not required)
| 1. | |
| ISBN：9780367737771 | |
| 2. | |
| John Wiley & Sons,Inc., 2003 | |
| ISBN：9780471378518 |
教學大綱
Syllabus:
| 1. | Introduction to Signals and Systems |
| 2. | Linear Time-Invariant Systems |
| 3. | Fourier Series Representation of Periodic Signals |
| 4. | The Continuous-Time Fourier Transform |
| 5. | The Discrete-Time Fourier Transform |
| 6. | Time and Frequency Characterization of Signals and Systems |
| 7. | Sampling |
| 8. | The Laplace Transform |
| 9. | Thez-Transform |
| ♠ Evaluation: Homework 30%; Midterm 35%; Finals 35% |
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11202
工程
分散式學習的最佳化和通訊演算法
洪樂文 教授
Syllabus
| 第1R講 | 分散式學習的最佳化和通訊演算法 〡Internet-of-Things(IOT)Applications |
| Learning from Decentralized Datasets- Optimization and Communication Aspects Centralized Architecture Distributed Architecture Mobile Application Medical Applications Internet-of-Things (IoT) Applications Basic (Supervised) Learning Task Distributed Implementation of GD | |
| | |
| 第2R講 | 分散式學習的最佳化和通訊演算法 〡Example:Federated Multi-task Learning |
|
Alternating Direction Method of Multipliers Core Challenges Example I: Federated Multi-task Learning Example II: Multi-View Clustering Go to Examples Go to Examples Example I: Federated Multi-task Learning | |
| | |
| 第3R講 | 分散式學習的最佳化和通訊演算法〡Example II :Multi-View Clustering |
| Example II: Multi-View Clustering Data Collection Local Subspace Clustering Center Broadcast | |
|
| |
瀏覽人次：1909
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自然科學
創新生命科學研究方法〡Offered in English❤️0502微調中❤️
王慧菁 / 廖品超 / 陳韋靜 / 周雅菁 / 林郁婷 / 李以如 / 林珮君 / 謝琬甄 教授
本課程主要講授發表在Nature Methods期刊中的新興醫學及生命科學研究方法，並探討這些技術的未來應用。
課程簡述
Brief course description
本課程主要講授發表在Nature Methods期刊中的新興醫學及生命科學研究方法，並探討這些技術的未來應用。
This lecture will be given in English.
The lectures will focus on introducing select key methodologies published in the prestigious journal Nature Methods, as well as discussing their potential future implications. The teachers will introduce 17 different method topics and the lecture will be given in a hybrid mode (physical ＋ online).
This lecture will be given in English.
The lectures will focus on introducing select key methodologies published in the prestigious journal Nature Methods, as well as discussing their potential future implications. The teachers will introduce 17 different method topics and the lecture will be given in a hybrid mode (physical ＋ online).
課程說明
Course Description
Nature Methods is a monthly journal publishing novel methods and significant improvements to basic life sciences research techniques. The journal is aimed at a broad, interdisciplinary audience of academic and industry researchers actively involved in laboratory practice. It provides researchers with new tools to conduct their research and places a strong emphasis on immediate practical relevance and potential to advance new biological applications.
We noted that each paper published in Nature Methods must be accompanied by strong validation, an application to an important biological question and results illustrating its performance in comparison to available approaches. Thus, papers are selected for publication based on broad interest, thorough assessments of methodological performance and comprehensive technical descriptions that facilitate immediate application. Accordingly, we believe our students may benefit a lot by learning these new methods.
We noted that each paper published in Nature Methods must be accompanied by strong validation, an application to an important biological question and results illustrating its performance in comparison to available approaches. Thus, papers are selected for publication based on broad interest, thorough assessments of methodological performance and comprehensive technical descriptions that facilitate immediate application. Accordingly, we believe our students may benefit a lot by learning these new methods.
指定用書
Textbook Book
| ♠ | Nature methods |
| The electronic international standard serial number (EISSN) is 15487105. | |
| https://www.nature.com/nmeth/ | |
| https://www.nature.com/nmeth/articles?type=method-to-watch |
教學方式
Teaching Method
Each lecture will consist of two parts. The first part will feature lectures given by individual teachers, while the second part will involve student presentations and discussions guided by the teachers
教學進度
Course Content
Course Content
Please see the following table.
| Week | Date | Teacher | Topic | |
| 1 | 09/14 | Lily Wang | General lecture introduction | |
| Topic-1: Method to watch 2022: Imaging without the labels https://www.nature.com/articles/s41592-02101376-0 Topic-2: Organic dyes for live imaging https://www.nature.com/articles/s41592-020-01032-z | ||||
| 2 | 09/21 | Wei-Ching Chen | Topic-3: Method to watch 2020: Tools for metabolomics http:://www.nature.com/articles/s41592-019-0710-6 | |
| Topic-4: Method to watch 2023: Annotating unknown metabolites http://www.nature.com/articles/s41592-022-01735-5 | ||||
| 3 | 09/28 | Teacher’s | day | |
| 4 | 10/05 | Pei-Chun Lin | Topic-5: ClampFISH Nat Methods 19, 1403–1410 (2022). https://doi.org/10.1038/s41592-022-01653-6 | |
| Student presentation | ||||
| 5 | 10/12 | Ya-Ching Chou | Topic-6: Joint profiling of DNA methylation and chromatin architecture in single cells https://www.nature.com/articles/s41592-0190502-z | |
| Student presentation | ||||
| 6 | 10/19 | I-Ju Lee | Topic-7: Next-Generation Expansion Microscopy https://www.nature.com/articles/s41592-023-01793-3 and related articles | |
| Student presentation | ||||
| 7 | 10/26 | Yu-Ting Lin | Topic-8: Controlling cellular activities with light Nat Methods 20, 357–358 (2023) https://www.nature.com/articles/s41592-022-01745-3 | |
| Student presentation | ||||
| 8 | 11/02 | Pei-Chun Lin | Topic-9: Cryo-electron tomography Nat Methods (2023). https://doi.org/10.1038/s41592023-01783-5 | |
| Student presentation | ||||
| 9 | 11/09 | I-Ju Lee | Topic-10: Methods to watch 2023: A light switch for targeted genomics https://www.nature.com/articles/s41592-022-01733-7 | |
| Student presentation | ||||
| 10 | 11/16 | Ya-Ching Chou | Topic-11: SpaGCN: Integrating gene expression, spatial location and histology to identify spatial domains and spatially variable genes by graph convolutional network https://www.nature.com/articles/s41592-021-01255-8 | |
| Student presentation | ||||
| 11 | 11/23 | Lily Wang | Topic-12: Neuroscience goes viral https://www.nature.com/articles/s41592-021-01373-3 | |
| Student presentation | ||||
| 12 | 11/30 | Wan-Chen Hsieh | Topic-13:T cell development in a dish Nature Methods volume 18, page35 (2021) https://www.nature.com/articles/s41592-020-01047-6 | |
| Student presentation | ||||
| 13 | 12/07 | Yu-Ting Lin | Topic-14: Patch-seq technique Nat Methods 19, 1340–1344 (2022) https://www.nature.com/articles/s41592-022-01662-5 | |
| Student presentation | ||||
| 14 | 12/14 | Wan-Chen Hsieh | Topic-15:Macrophages enter CAR immunotherapy Nature Methods volume 17, page 561 (2020) https://www.nature.com/articles/s41592-020-0862-4 | |
| Student presentation | ||||
| 15 | 12/21 | Pin-Chao Liao | Topic-16:Automated segmentation and tracking of mitochondria in live-cell time-lapse images Nature Methods volume 18, pages 1091–1102 (2021) https://www.nature.com/articles/s41592-021-01234-z | |
| Student presentation | ||||
| 16 | 12/28 | Pin-Chao Liao | Topic-17: Actin chromobody imaging reveals suborganellar actin dynamics Nature Methods volume 17, pages 917–921 (2020) https://www.nature.com/articles/s41592-020-0926-5 | |
| Student presentation |
成績參考
| ♠ | Course participation: 20% |
| ♠ | Presentation: 80% (40% classmates, 40% teacher) |
相關網頁
| ♠ | https://www.nature.com/nmeth/ |
| ♠ | https://www.nature.com/nmeth/articles?type=method-to-watch |
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